天平宝字元年（757年）日光山を開く勝道上人（しょうどうしょうにん）によって当山奥之院三昧石（三枚石）が開創されました。上人が二十三歳の時、下野の出流山（いずるさん）より三昧石に着いた際、峯に古色蒼然とした広大な原野があるので古峯原（こぶがはら）と名付けられました。また、一説には『花供（はなく）の峯』から『供峯（くぶ）』へ、更に『古峯（こぶ）』になったとも言われています。
　金剛山という名称は【弘法大師が上人の遺弟道珍法師に金剛界の大法を授けたという説】と【1335年頃に後醍醐天皇の勅願によって大和の国（奈良県）葛城別当賢道（けんどう）僧正によって葛城金剛山の分霊を奉じて本尊金剛童子を祀った説】があります。
　日光山発展と共に古峯原も峯修行に多くの修行者が来山し興隆してまいりましたが、明治初年の神仏分離令による政体の変更、大正八年の大洪水による本堂並びに庫裡・客殿の流出等により当山も一時哀徴の一途をたどりましたが、有縁の浄地を現在地に求め本堂を建立、法燈を護持して霊域も回復、今日に至っております。